Hemos encontrado una pequeña respuesta a esta pregunta en esta página en inglés. Recomendamos su lectura a todo el que se defienda con el idioma.

Básicamente plantea la necesidad de hacer un estudio adecuado antes de usar biodiesel en un avión por razones obvias de seguridad. El caso es que se puede usar en aviones conmotores diesel pero de forma mezclada, por cuestiones de presión y temperatura en la altitud a la que vuelan los aviones.

Por otro lado también se plantea la posibilidad de que un Boing 747 pueda usarlo, y es aquí donde la cuestión se complica mucho, ya que los motores de turbina como el de un 747, no pueden usar diesel por motivos de seguridad.

En fin, que queda reservado para pequeños aviones, pero utilizarse se utiliza.